Real-time PCR

Hvad er real-time PCR?

Real-time PCR (eller qPCR, som betyder kvantitativ PCR) er en variant af PCR-metoden, der bruges til at undersøge, om en bestemt type DNA findes i en miljøprøve. Man undersøger samtidig, hvor stor en mængde af DNA'et der er til stede. Metoden kaldes også for måling af eDNA (miljø-DNA).

Real-time PCR bruges især inden for måling af biodiversitet, hvis man vil vide, om en bestemt art er til stede i et økosystem, og hvor mange individer der er til stede. Her udnytter man, at levende organismer hele tiden afgiver DNA til deres omgivelser. DNA fra en art nedbrydes desuden ret hurtigt, hvis arten forsvinder fra økosystemet. 

Sådan foregår real-time PCR

Real-time PCR udføres typisk på vandprøver. Man tager en vandprøve fra f.eks. en sø og tilsætter primere. Primerne passer sammen med DNA fra de arter, man gerne vil undersøge tilstedeværelsen af. Man tilsætter samtidig en bestemt mængde kontrol-DNA og primere, der passer sammen med kontrol-DNA'et.

PCR-proceduren udføres nu som beskrevet på foregående ...