Opgave 1. Slangemodgift

Indhold

1.

Redegør for de sekundære strukturer af α-dendrotoksin, vist i figur 1b, og marker eksempler på disse.

Sekundærstrukturen er aminosyrekædens lokale foldninger.

Sekundærstrukturerne hos et protein er de strukturer, som proteinkæden folder sig til lokalt. Foldningerne opstår, fordi atomer i aminosyrerne danner hydrogenbindinger mellem hinanden. Derved kan der opstå to forskellige strukturer: beta-foldeblade og alfa-helixer. På figuren er afmærket en alfa-helix i den nederste blå cirkel (spiralformet) og et beta-foldeblad i den øverste blå cirkel (fladt bånd).

2.

Angiv, hvordan α-dendrotoksin kan bindes til de spændingsstyrede kaliumkanaler.

Kaliumkanaler i neuroner er spændingsstyrede. Na+-ioner uden for neuronet kan binde til et negativt ladet bindingssted uden på kanalen, hvorved kanalen holdes lukket, når neuronet er i hvile. Visse andre positivt ladede ioner kan dog også binde til det negativt ladede bindingssted. Det fremgår af figur 3, at både lysin og arginin har en positivt ladet R-gruppe ved neutral pH-værdi. Derfor kan disse aminosyrer i α-dendrotoksins aktive center binde til bindingsstederne på de spændingsstyr...