Opgave 3. TRPV1 og capsaicin
1.
Beskriv receptorproteinets struktur. Inddrag figur 2.
Proteinets struktur kan beskrives på fire forskellige niveauer: den primære, sekundære, tertiære og kvarternære struktur.
Den primære struktur er aminosyrernes rækkefølge i kæden. Primærstrukturen foldes til proteinets sekundære struktur. Sekundærstrukturen er aminosyrekædens lokale rumlige opbygning, som afhænger af, hvilken type hydrogenbindinger der dannes mellem aminosyrernes sidekæder. Alfa-bindinger mellem radikalerne resulterer i alfa-helix-strukturer, mens beta-bindinger mellem radikalerne resulterer i beta-foldeblads-strukturer. Figuren viser, at proteinet indeholder mange alfa-helixer, mens vi ikke umiddelbart ser nogen beta-foldeblade på figuren. Proteinets tertiære struktur er foldningen af peptidkæden til den større tred...