Opgaver med afstandsmatricer

En afstandsmatrice er et skema, som viser antallet af forskelle mellem basesekvenser, der findes samme sted i genomet hos forskellige populationer eller arter. Afstandsmatricer giver derfor et overblik over, hvor nært beslægtede forskellige arter eller populationer er.

Du skal indimellem enten udfylde en afstandsmatrice eller analysere en afstandsmatrice i eksamensopgaver. Afstandsmatricer indgår i opgaver om slægtskabsanalyser og fylogenetiske stamtræer. Læs mere om slægtskabsanalyser på siderne om slægtskabsanalyse længere tilbage i kompendiet.

Sådan er afstandsmatricen opbygget

Opgaver med afstandsmatricer indeholder basesekvenser fra en række populationer/arter og en afstandsmatrice, som er helt eller delvist udfyldt. Det kan eksempelvis se således ud:

Art 1      AGGCTGCAGCGTGGTTTGATG

Art 2      AGGCTGCAGCCCGGTTTGATG

Art 3      AAGCTGCAGCGCGGTGTGATG